べフォールの子供たちはとある図書館の地下に隠しておいた自分たちの記憶のクリスタルを回収するが、そのときに彼らが「やつら」と呼ぶ謎の闇の塊に襲撃される。
物語は2億光年という気の遠くなるような宇宙空間と地球上での500年という時空と世紀を越えて旅をする子供たちのラブストーリー。