地球の反応がおかしかったため、ハーロックたちはバミューダ海域へと向かう。海底でマゾーンが建設したと思われるピラミッドを発見したハーロックたちは、マゾーンが植物性の生命体だと推測する。
宇宙をまたにかけ、戦い続ける孤高のヒーロー。その名は宇宙海賊・キャプテンハーロック!