ハーロックは、ヤッタラン副長に捕虜の確保を命じた。しかし逆にヤッタランはマゾーンに捕らわれてしまう。ヤッタランからの情報収集を指示されたマゾーンのエルザは、彼のプラモ好きを利用し…!?
宇宙をまたにかけ、戦い続ける孤高のヒーロー。その名は宇宙海賊・キャプテンハーロック!