アーチャーによって、アインツベルグ城から逃れた士郎たち。だが、セイバーの限界を感じ、森の廃屋に身を隠す。このままではセイバーが消滅し、追撃してくるバーサーカーにも対抗できない…!?
手にした者の願いを叶えるという聖杯をめぐり、“聖杯戦争”と呼ばれる魔術師同士の戦いを壮大なスケールで描く。