聖杯より溢れ出す呪いにとらわれ、苦悶する士郎。その頃、セイバーはギルガメッシュに苦戦していた。絶体絶命の危機をむかえたとき、聖剣の鞘「全て遠き理想郷(アヴァロン)」が現れて…!?
手にした者の願いを叶えるという聖杯をめぐり、“聖杯戦争”と呼ばれる魔術師同士の戦いを壮大なスケールで描く。